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共发生网络(Co-occurrence)
【添加时间:2016-09-12 09:35:08】【来源:】【作者:dggadmin】
        Co-occurrence网络可以揭示微生物群落中菌群之间的生态学关系。在正相关为主的网络中,网络模块(module)相当于适应同一生态位的菌群,它们倾向于共发生。通过Mantel test可以找出影响这些模块的关键环境因子。每个网络包含的样品数目最好不低于8个。  
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图1 两个Co-occurrence网络
        ​图中的节点表示OTU,边(两节点之间的连线)表示两个OTU存在显著正相关(Spearman ρ>0.6, p<0.01)。节点大小表示该节点的边数目多少,边的粗细代表相关性大小,颜色代表同一模块,节点标签是OTU所属菌群分类。



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