细菌基因组测序
细菌基因组测序
【添加时间:2016-09-22 10:10:13】【来源:】【作者:dggadmin】
       由于具有读长长的特点,第三代测序平台在基因组测序中能降低测序后的Contig数量,明显减少后续的基因组拼接和注释的工作量,节省大量的时间。
       SMRT测序技术做细菌全基因组测序的技术路线如下:
       文库构建 -> PacBio测序 -> 序列组装 ->  绘制基因组完成图 -> 生物信息分析

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图1 细菌全基因组测序流程

       生物信息分析包括:基因预测及功能注释、基因家族分析、共线性分析、非编码RNA注释、重复序列注释、CRISPR预测、前噬菌体预测、基因岛预测等。

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图2 基因组及甲基化组完成图示例
      



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